De la création à la série A, les chiffres d'une startup sont scrutés en permanence : par les fonds qui entrent au capital, par les banques qui accordent des prêts d'amorçage, par l'administration qui contrôle le crédit d'impôt recherche. La loi de finances pour 2026 a en outre retouché les BSPCE et créé un nouveau statut fiscal. TEC, Trouver expert-comptable, vous aide à trouver un cabinet habitué à ce rythme : après un échange sur votre projet, notre conseiller vous présente un seul cabinet, gratuitement et partout en France.
Avant l'immatriculation : les choix qui engagent
Que votre projet soit hébergé dans un incubateur universitaire à Strasbourg, dans une pépinière à Rennes ou dans un programme d'accélération à Lille, les premières décisions ont des effets durables. Forme de la société, montant du capital, répartition des actions entre fondateurs, clauses d'acquisition progressive des titres : un investisseur relira tout cela lors de la première levée.
L'expert-comptable intervient aussi sur le prévisionnel, le plan de trésorerie et l'organisation comptable à mettre en place dès la première facture. Il est plus simple de démarrer proprement que de reprendre des comptes désordonnés à la veille d'un tour de table.
Crédit d'impôt recherche : un levier de trésorerie
Le crédit d'impôt recherche est égal à 30 % des dépenses de recherche éligibles, dans la limite de 100 millions d'euros. Depuis la loi de finances pour 2025, les dépenses de fonctionnement sont prises en compte de façon forfaitaire à 40 % des dépenses de personnel affecté à la recherche. La créance se déclare avec le formulaire 2069-A-SD.
Une startup sans bénéfice ne peut pas l'imputer sur un impôt qu'elle ne paie pas. Les jeunes entreprises et les JEI peuvent heureusement en obtenir le remboursement immédiat. Le cabinet calcule le montant, dépose la demande et vous aide à constituer le dossier technique qui justifiera les dépenses si l'administration le demande.
Choisir le bon statut : JEI, JEC ou JEII
La jeune entreprise innovante doit être une PME dont les dépenses de recherche atteignent au moins 20 % de ses charges. D'après service-public.fr, les JEI créées à partir du 1er janvier 2024 ne bénéficient plus de l'exonération d'impôt sur les bénéfices. L'avantage tient désormais principalement aux exonérations de cotisations patronales sur les salaires des personnels de recherche.
Entre 5 % et 20 % de dépenses de recherche, deux autres statuts existent. La jeune entreprise de croissance exige une progression des effectifs. La jeune entreprise d'innovation à impact, créée par la loi de finances pour 2026, vise les entreprises de l'économie sociale et solidaire, pour les exercices clos entre le 21 février 2026 et la fin de 2028. Le ratio de recherche se recalcule à chaque exercice : s'il baisse, les avantages peuvent tomber.
Associer vos salariés avec des BSPCE
Les bons de souscription de parts de créateur d'entreprise, encadrés par l'article 163 bis G du code général des impôts, restent l'outil le plus utilisé pour intéresser une équipe au capital. Pour les bons attribués depuis le 1er janvier 2026, le capital de la société émettrice doit être détenu directement pour 15 % au moins par des personnes physiques, contre 25 % auparavant. Une startup qui a déjà cédé beaucoup de capital à des fonds peut donc continuer à en émettre.
La réforme permet aussi d'attribuer des bons aux salariés et dirigeants des sous-filiales, sous conditions. Attention au cas du bénéficiaire qui cède ses titres alors qu'il exerce dans la société depuis moins de trois ans : son gain est taxé à 30 %, sans possibilité d'opter pour le barème. Le cabinet tient à jour le registre des plans et le calcul des gains.
Passer l'audit d'un fonds sans mauvaise surprise
Avant d'investir, un fonds mène un audit d'acquisition. Il demande les derniers comptes approuvés, la table de capitalisation, les contrats importants, la situation sociale et fiscale. Un cabinet réactif répond à ces questions dans les délais et corrige en amont ce qui pourrait retarder la signature.
Il enregistre ensuite l'augmentation de capital et la prime d'émission, et vérifie que les obligations d'information prévues au pacte d'associés sont compatibles avec votre organisation comptable.
Rendre des comptes après la levée
Les investisseurs veulent suivre chaque mois la consommation de trésorerie, le nombre de mois de financement restants et l'écart entre le budget voté et le réalisé. Un cabinet habitué aux startups organise des clôtures mensuelles simplifiées et un tableau de bord identique d'un conseil à l'autre, que vous pouvez envoyer sans le retravailler.
Pour trouver ce type de cabinet, notre conseiller Fabien Peduzzi, sept ans d'expérience en cabinet d'expertise comptable, écoute votre projet et votre calendrier de financement, puis vous présente un seul interlocuteur. Le service ne vous coûte rien et TEC n'est pas un cabinet.
Dispositifs fiscaux de l'innovation en 2026
| Mesure | Condition clé | À surveiller |
|---|---|---|
| Crédit d'impôt recherche | 30 % des dépenses éligibles jusqu'à 100 millions d'euros | Frais de fonctionnement forfaitisés à 40 % des dépenses de personnel |
| Jeune entreprise innovante | PME consacrant au moins 20 % de ses charges à la recherche | Exonération d'impôt sur les bénéfices supprimée pour les JEI créées depuis 2024 |
| Jeune entreprise de croissance | Entre 5 % et 20 % de dépenses de recherche, effectifs en hausse | Preuve de la croissance à conserver |
| Jeune entreprise d'innovation à impact | Entre 5 % et 20 % de dépenses de recherche, entreprise de l'économie sociale et solidaire | Applicable aux exercices clos à compter du 21 février 2026 |
| BSPCE | Capital détenu à 15 % au moins par des personnes physiques pour les bons attribués depuis 2026 | Taxation à 30 % du gain si moins de trois ans de fonctions |
Les questions à poser au cabinet
- Combien de startups ayant levé des fonds suivez-vous actuellement ?
- Pouvez-vous répondre directement aux questions d'un fonds pendant son audit ?
- Qui calcule notre ratio de dépenses de recherche et à quel moment de l'année ?
- Tenez-vous le registre de nos BSPCE et l'information des bénéficiaires ?
- Sous quel délai livrez-vous une clôture mensuelle et un tableau de bord ?
Pas le temps de comparer ? Un conseiller fait le point avec vous et vous présente un seul cabinet adapté. Parler à un conseiller
